Когда началась война, Гена Трофимов закончил 9 классов. Ему было 17 лет. На фронт его не взяли, в армию он был призван в конце 1942 года и направлен в Омское пехотное училище, которое окончил в 1943 году.
1 сентября 1943 года в четвертую годовщину гитлеровского нападения на Польшу была сформирована первая польская дивизия имени Тадеуша. Костюшко, преобразованная потом в польскую армию, которой было передано несколько советских соединений. В одном из них и служил лейтенант Геннадий Трофимов.
В 1944 году в Тобольск родным пришла похоронка, извещавшая, что лейтенант Геннадий Иванович Трофимов погиб смертью храбрых в боях за Советскую Родину.